Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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