Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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