Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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HOXD1Q9GZZ0 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HOXD1Q9GZZ0 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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