Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms