Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms