Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRIM63Q969Q1 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRIM63Q969Q1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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