Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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FOXD1Q16676 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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FOXD1Q16676 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
FOXD1Q16676 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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FOXD1Q16676 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
FOXD1Q16676 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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