Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HIF1AQ16665 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HIF1AQ16665 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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