Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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NEDD8Q15843 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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NEDD8Q15843 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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NEDD8Q15843 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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NEDD8Q15843 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NEDD8Q15843 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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