Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ALX1Q15699 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms