Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SIX1Q15475 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SIX1Q15475 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SIX1Q15475 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SIX1Q15475 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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