Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EEA1Q15075 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
EEA1Q15075 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms