Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BECN1Q14457 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
BECN1Q14457 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
BECN1Q14457 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BECN1Q14457 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
BECN1Q14457 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BECN1Q14457 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms