Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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