Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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