Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
ALCAMQ13740 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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