Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SNW1Q13573 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SNW1Q13573 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms