Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HDAC1Q13547 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms