Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATMQ13315 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATMQ13315 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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