Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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