Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SRSF6Q13247 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SRSF6Q13247 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SRSF6Q13247 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms