Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
PRDM2Q13029 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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