Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ECH1Q13011 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ECH1Q13011 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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