Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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BNIP1Q12981 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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BNIP1Q12981 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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BNIP1Q12981 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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BNIP1Q12981 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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BNIP1Q12981 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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BNIP1Q12981 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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BNIP1Q12981 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
BNIP1Q12981 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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