Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTP4A2Q12974 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTP4A2Q12974 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTP4A2Q12974 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTP4A2Q12974 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTP4A2Q12974 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTP4A2Q12974 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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