Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GRIN2AQ12879 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GRIN2AQ12879 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
GRIN2AQ12879 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GRIN2AQ12879 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GRIN2AQ12879 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GRIN2AQ12879 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2AQ12879 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms