Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IFFO1Q0D2I5 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms