Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 397.5 ms