Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPEQ02224 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms