Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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