Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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GDE1Q9NZC3 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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GDE1Q9NZC3 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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GDE1Q9NZC3 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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GDE1Q9NZC3 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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GDE1Q9NZC3 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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GDE1Q9NZC3 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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GDE1Q9NZC3 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GDE1Q9NZC3 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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