Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms