Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf116Q5BN46 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms