Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ANKRD39Q53RE8 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ANKRD39Q53RE8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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