Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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