Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PTPROQ16827 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPROQ16827 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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