Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN21Q16825 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms