Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms