Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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RPE65Q16518 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPE65Q16518 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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