Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZFHX3Q15911 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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