Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ALX1Q15699 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ALX1Q15699 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ALX1Q15699 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ALX1Q15699 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
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ALX1Q15699 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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ALX1Q15699 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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ALX1Q15699 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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ALX1Q15699 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
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ALX1Q15699 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ALX1Q15699 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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