Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ZNHIT3Q15649 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms