Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms