Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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