Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SMCO1Q147U7 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMCO1Q147U7 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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