Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RRP1BQ14684 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RRP1BQ14684 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms