Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MDC1Q14676 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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