Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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