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| CAPRIN1 | Q14444 | ARHGAP15-202 | ENST00000409869 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RN7SKP140-201 | ENST00000411196 | 284 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CAPRIN1 | Q14444 | RICTOR-202 | ENST00000357387 | 9543 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | MTND4P14-201 | ENST00000435799 | 1354 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | ATP8A2P2-201 | ENST00000437678 | 1568 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | TSLP-202 | ENST00000379706 | 2411 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | AC016717.2-201 | ENST00000609089 | 5141 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | SNX10-209 | ENST00000619420 | 2361 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | MINPP1-204 | ENST00000536010 | 2215 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RNU6-552P-201 | ENST00000362869 | 119 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | Y_RNA.72-201 | ENST00000362894 | 103 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | Y_RNA.138-201 | ENST00000363462 | 102 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RNU5E-6P-201 | ENST00000365574 | 115 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CAPRIN1 | Q14444 | SNORD37.1-201 | ENST00000390968 | 65 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CAPRIN1 | Q14444 | RNU2-39P-201 | ENST00000410604 | 198 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RNU4-53P-201 | ENST00000410828 | 140 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | RN7SKP192-201 | ENST00000411291 | 327 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | AL451054.2-201 | ENST00000420896 | 202 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CAPRIN1 | Q14444 | Z82210.1-201 | ENST00000440037 | 231 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | AL031659.1-201 | ENST00000447075 | 539 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CAPRIN1 | Q14444 | LINC00395-202 | ENST00000451570 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |