Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ERV3-1Q14264 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms